Stipendiaten 2006

Felix Bonowski

Projekttitel: Entwicklung einer Open Source Software zur Signalanalyse in Massenspektren
Hochschule: Universität Heidelberg
Studiengang: Molekulare Biotechnologie

Kurzbeschreibung

Die Entwicklung neuer Massenspektrometer ermöglicht heute die routinemäßige Vermessung von Mischungen „großer“ Moleküle, wie sie in lebenden Zellen vorkommen. Anwendungen ergeben sich insbesondere in der molekularbiologischen Forschung und der medizinischen Diagnostik.

Während der experimentelle Aufwand zur Aufnahme eines Spektrums stetig sinkt, entwickelt sich die immer noch gängige manuelle Auswertung zunehmend zu einem Flaschenhals.

Die existierenden kommerziellen Auswertungsprogramme sind meist nur zusammen mit Geräten eines bestimmten Herstellers verwendbar und nur für Spektren sehr guter Qualität geeignet.

Felix Bonowski entwickelt ein Softwarepaket zur automatischen Ermittlung der Massen der in einem Gemisch enthaltenen Moleküle unter Zuhilfenahme mathematischer Modelle der erwarteten Signalformen und Messcharakteristika verschiedener massenspektrometrischer Techniken. Durch die statistische Modellierung des Messvorgangs einschließlich der vorhandenen „Schmutzeffekte“ soll die Verwendbarkeit auch bei Spektren niedriger Intensität und Auflösung gewährleistet werden. Ein von ihm entwickeltes Verfahren ermöglicht zudem die Trennung von im Spektrum überlagerten Signalen und ermöglicht so die automatische Auswertung von Spektren komplexer Mischungen.

Die Ergebnisse des Projekts werden der Allgemeinheit in Form quelloffener Software zur Verfügung gestellt.